Lehre
Studieren am Lehrstuhl für Bioinformatik II
Nächster F1 Kurs im Sommersemester 26: 09.03.-24.04.2026
Dieser Kurs richtet sich an Masterstudierende mit Interesse an Bioinformatik und RNA-Sequenzierung. In sechs Wochen lernen die Teilnehmenden, RNA-Seq-Daten in R zu analysieren und Genexpressionsänderungen unter verschiedenen zellulären Bedingungen zu untersuchen. Der Fokus liegt auf praxisnahen bioinformatischen Methoden, unter anderem der Analyse von Genetischen Varianten, der differentiellen Genexpressionsanalyse und alternative Spleißen. Alle Teilnehmenden führen diese Analysen anhand von eigenen Beispiel Datensätzen selber mit dem Galaxy Server und in der Programmiersprache R durch. Es sind keine Vorkenntnisse im Programmieren nötig, da wir die erste Woche des Kurses R basics machen.
Kursplan:
Woche 1 R Basics (3h pro Tag Präsenz + Übungsaufgaben)
Woche 2-4 Step-by-Step Analysen der Daten (3h pro Tag Präsenz + Eigenständiges Weiterführen der Analysen)
Woche 5-7 Finalisieren der Analysen (Eigenständige Arbeit)
Finale Abgaben: Posterpresentation in Kleingruppen & Individuelle Protokollabgabe
Anmeldung: Mail an Prof. Kathi Zarnack
Im F2 Praktikum oder anderen Praktika arbeiten die Studierenden selbstständig and einem Forschungsprojekt und werden dabei von einem unserer Gruppenmitglieder betreut. Zusätzlich nehmen die Studierenden an den meetings der Arbeitsgruppe (Scrum meeting, Group Seminar & WueBiT Seminar, Journal club und code review) teil um ihre Fachkenntnisse zu vertiefen.
Vorraussetzungen: Voraussetzung für das F2 Praktikum ist die erfolgreiche Teilnahme am F1 Praktikum!
Projekte: Die Projektthemen werden vom jeweiligen Betreuer zusammen mit Prof Kathi Zarnack geplant. Bei Anmeldung wird Kathi mit dir die möglichen Projekte besprechen.
Anmeldung: Mail an Prof. Kathi Zarnack
Länge: Die Länge des Praktikums ist abhänig von der jeweiligen Studienordnung.
Arbeitsplatz: Studiernde bekommen einen Arbeitsplatz bei uns im Büro, es kann aber zum Teil im homeoffice geaorbeitet werden.
In einer Bachelor oder Masterthesis arbeiten die Studierenden selbstständig and einem Forschungsprojekt und werden dabei von einem unserer Gruppenmitglieder betreut. Zusätzlich nehmen die Studierenden an den meetings der Arbeitsgruppe (Scrum meeting, Group Seminar & WueBiT Seminar, Journal club und code review) teil um ihre Fachkenntnisse zu vertiefen.
Vorraussetzungen: Voraussetzung für eine Thesis ist ein bei uns erfolgreich abgeschlossenes Praktikum!
Projekte: Die Projektthemen werden vom jeweiligen Betreuer zusammen mit Prof Kathi Zarnack geplant. Bei Anmeldung wird Kathi mit dir die möglichen Projekte besprechen.
Anmeldung: Mail an Prof. Kathi Zarnack
Länge: Die Länge der Thesis ist abhänig von der jeweiligen Studienordnung.
Arbeitsplatz: Studiernde bekommen einen Arbeitsplatz bei uns im Büro, es kann aber zum Teil im homeoffice gearbeitet werden.
