Bioinformatik | Kleine nicht-codierende RNAs

Forschung

Mein Forschungsschwerpunkt sind kleine nicht-kodierende RNAs.

In einem aktuellen Projekt untersuche ich den Einfluss von Piwi-interagierenden RNAs (piRNAs) auf die Genomausdehnung bei verschiedenen Lungenfischarten. Darüber hinaus interessiere ich mich für die Beteiligung von piRNAs und miRNAs an der Entstehung von Krebs. Ein weiterer Aspekt meiner Forschung umfasst genomweite Selektionsanalysen zur Identifizierung von Genen, die möglicherweise für die Anpassung an Umweltbedingungen relevant sind.

Schlüsselbegriffe sind die statistische und bioinformatische Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten, kleine nicht-kodierende RNAs, genomweite Selektionsanalysen und die Analyse von Daten, die aus verschiedenen Sequenzierungstechniken von genomischen sowie transkriptomischen Proben stammen.

Kurz-CV

2011- Wissenschaftliche Mitarbeiterin
Lehrstuhl für Biochemie und Zellbiologie, JMU Würzburg
2000-2011 Laborleiterin
für Microarray-Anwendungen und bioinformatische Analysen von Hochdurchsatzverfahren, Interdisziplinäres  Zentrum für Klinische Forschung (IZKF), JMU Würzburg
1997-2000 PostDoc
Forschungsruppe von Prof. R. Kucherlapatis, Department of Molecular Genetics, Albert Einstein College of Medicine, New York, USA
1995-1996

Wissenschaftliche Assistentin
Bildanalyselabor, Institut für Virologie, JMU Würzburg
1993-1995

Doktorandin
Bildanalyselabor, Institut für Virologie, JMU Würzburg
1984-1990

Studium der Veterinärmedizin
Ludwig-Maximilians-Universität München

Ausgewählte Publikationen

Schartl et al  

 
The genomes of all lungfish inform on genome expansion and tetrapod evolution
 

Nature (2024)

Fetiva et al

Oncogenic YAP mediates changes in chromatin accessibility and activity that drive cell cycle gene expression and cell migration
 

Nucleic Acid Resarch (2023)

Lu et al  

High resolution genomes of multiple Xiphophorus species provide new insights into microevolution, hybrid incompatibility, and epistasis

Genome Research (2023)

Meyer et al  

 
Giant lungfish genome elucidates the conquest of land by vertebrates
 

Nature (2021)

Du et al

 
The sterlet sturgeon genome sequence and the mechanisms of segmental rediploidization
 

Nat Ecol Evol (2020)

Jessen et al

The transcription factor NRF2 enhances melanoma malignancy by blocking differentiation and inducing COX2 expression
 

Oncogene (2020)

Kneitz et al

 
Germ cell and tumor associated piRNAs in the medaka and Xiphophorus melanoma models
 

BMC Genomics (2016)